Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms