Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nme1P15532 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms