Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms