Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RaraP11416 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RaraP11416 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RaraP11416 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RaraP11416 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RaraP11416 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RaraP11416 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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