Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GzmdP11033 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms