Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms