Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms