Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms