Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06323 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06323 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P06323 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms