Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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P01727 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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P01727 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01727 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01727 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01727 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01727 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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