Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CopeO89079 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CopeO89079 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CopeO89079 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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