Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms