Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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