Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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