Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NlkO54949 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NlkO54949 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms