Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CrxO54751 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CrxO54751 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrxO54751 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrxO54751 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms