Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms