Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab33bO35963 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms