Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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