Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tfdp1-203ENSMUST00000209396 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 8430436N08Rik-201ENSMUST00000129988 1077 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms