Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC024978J3QPC3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms