Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms