Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms