Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20825J3QM67 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms