Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3727J3QM54 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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