Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21244J3QK38 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms