Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms