Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms