Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nccrp1G3X9C2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nccrp1G3X9C2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nccrp1G3X9C2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nccrp1G3X9C2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nccrp1G3X9C2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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