Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms