Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21977F6U3N7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms