Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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