Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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