Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms