Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms