Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms