Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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