Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm43720E0CXM8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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