Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms