Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms