Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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