Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd1D3YXK1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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