Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ube2d4D3YUH6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms