Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms