Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms