Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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