Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms