Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms