Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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