Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms